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院系设置如下：

文理与工程学院（College of Arts, Sciences, and Engineering）：罗切斯特最大的学院，分为文理学院和哈基姆工程学院两个子学院，设有本科专业和研究生专业。

音乐学院（The Eastman School of Music）：是罗切斯特最为著名的学院，在美国久负盛名。同时提供本科和研究生两个阶段的教育，包含作曲、音乐理论、音乐表演等专业。

教育与人类发展学院（The Margaret Warner Graduate School of Education and Human Development）：仅提供研究生教育，位于罗切斯特大学河滨校区（River Campus）。

医学与牙医学院（The School of Medicine and Dentistry）：提供研究生教育和临床教育，位于罗切斯特大学医学中心。

护理学院（School of Nursing is a nursing school）：同样位于罗切斯特大学的医学中心。

商学院（William E. Simon Graduate School of Business Administration）：位于河滨校区。

罗切斯特大学计算机科学系（Department of Computer Science）研究生阶段开设有以下学位项目，分别是：

计算机科学博士（PhD in Computer Science）：为期4-5年（视论文完成情况），要求申请者本科毕业，拥有计算机科学相关背景。该项目学生可获得TA、RA或Fellowship奖学金，自动随Offer发放，无需单独申请。

计算机科学硕士（MS in Computer Science）：为期1-2年（由是否撰写论文而定），共需修够30个学分，如申请者本科毕业，拥有计算机科学或与之相关专业背景，为期3个学期。该项目适合不计划攻读PhD学位，尤其是本科非计算机科学专业背景，但希望今后从事计算机科学领域工作的人士申请。

计算机科学系成立于1974年秋季，于1995年开设PhD学位项目。目前该系PhD项目现有45名学生，MS有10名学生，近些年，约有1/3PhD学生获得终身教职，另有一些在谷歌、微软和IBM从事主要的实验室研究。

罗切斯特大学计算机科学专业设有以下研究方向：

计算机系统（Computer Systems）

人工智能（Artificial Intelligence）

理论计算机科学（Theoretical Computer Science）

人机交互（Human-Computer Interaction)