庆应义塾大学是日本久负盛名的世界著名研究型综合大学，素有亚洲第一私立学府之称，是日本历史最悠久的综合性高等教育机构。
自1858年创建之后，150多年来，庆应义塾大学通过在教育、研究、医疗领域的不懈努力，确立了日本一流大学的地位，也为社会各领域培养出了大批领军型的多元化人才，故该校科研水平、教育水平均获得了极高的评价。
现如今，庆应义塾大学是一所拥有10个学部，14个研究教育科和一批研究机构的日本一流大学。庆应义塾大学在日本的许多理科领域内都有着出色表现，例如，研究出的光电子纤维是世界上传输速率最快的，在分子发动机、干细胞、基因研究等生命科学等前沿学科也占据着先导地位。
理科优势专业：物理学、机械械工学、电子工学
9. 筑波大学
筑波大学入选了日本“超级国际化大学计划”A类一流院校，日本学术研究恳谈会（RU11）成员，东亚研究型大学协会成员，是日本著名的国立综合大学。
筑波大学的教育理念分别是“开放的大学”、“灵活的教育研究组织”、“新大学机构”，筑波大学十分注重开发学生的创新能力和素质培养，争取培养学生成为国际领域的研究型人才。
理工优势专业：生命科学与生物医学、自然科学、计算机科学
8. 大阪大学
大阪大学是一所日本知名、世界一流的著名研究型国立综合大学，在日本关西地区与京都大学一道在各个领域都起着重要作用。
作为日本国内的最高学府之一，大阪大学在全球都享有很高声望。大阪大学是日本国内第6所旧制帝国大学，以医学和自然科学起家，创立不久就以"理科的阪大"而展露头角。
理工优势专业：光电子学、生物科学、物理学
7. 九州大学
九州大学是一所一流研究型的国立综合大学，在日本乃至世界上均占有重要的学术地位。九州大学历来拥有良好的学风，治学严谨并重视学生的学习和实践，学风自由，注重开发学生潜力。
另外，九州大学平均9名学生中就有1位留学生，国际化程度可谓日本领先。
理科优势专业：计算机、生物食品学、物理学
6. 名古屋大学
名古屋大学，是一所日本知名、世界一流的著名研究型国立综合大学，日本中部地区最高学府，日本“超级国际化大学计划”A类一流院校。作为日本最年轻的旧帝国大学，从设立至今，名古屋大学一直稳居日本中部地区最高学府的地位，尤其以理工学研究而闻名于世。
理科优势专业：数理学、物理学、化学、生物理学、地球行星理学
5. 北海道大学
北海道大学是一所著名研究型国立综合大学，是代表日本最高学术水平的一流国立大学“旧帝一工神”之一。
学校于2014年入选日本“超级国际化大学计划”A类一流院校，是八大学工学系联合会、日本学术研究恳谈会（RU11）成员，是日本首座具有授予学士学位资格的一流高等学府。
根据2019年QS世界大学排名，北海道大学位列世界第128名，其化学、工程学、农学、林学等学科均位列世界前100。
理科优势专业：应用理工、信息电子、机械智能工学
4. 东北大学
东北大学是日本知名的帝国大学之一，入选日本“超级国际化大学计划”A类一流院校、日本G30计划，为八大学工学系联合会、日本学术研究恳谈会（RU11）成员、东亚研究型大学协会、环太平洋大学联盟的成员校，现已成为包括文、理、工、医、农各科的日本国立研究型综合大学。
根据最新的2019年QS世界大学排名，东北大学排名世界第77位，其材料、工程、物理、药学、语言学、社会学等学科均处于世界一流地位。
理科优势专业：物理学、天文学、应用化学
3. 东京工业大学
东京工业大学是日本理工科大学中的佼佼者，是专攻工程技术与自然科学的日本知名、世界一流的理工科大学。东京工业大学是日本超级国际化大学计划A类一流院校之一，也是日本八大学工学系联合会、RU11学术研究恳谈会、东亚研究型大学协会等学术组织的重要成员。
根据2019年发布的QS世界大学排名位列世界第58名，日本第3名。其在工程技术类排名世界第14名，日本第2名；自然科学类排名世界第24名，日本第3名，是一所名副其实的世界一流理工科大学。
理科优势专业：数学、物理、化学系、地球行星科学、数理计算机科学
2. 京都大学
京都大学在日本与东京大学齐名，是一所学科齐全、规模宏大的国立综合大学，日本继东京大学之后设立的第二所旧制帝国大学。作为日本国内的最高学府之一，京都大学在全球都享有很高的声望，被誉为“科学家的摇篮”。
在2019年发布的QS世界大学排名，京都大学位列全球第35位、日本第2位。在2019年THE世界大学排名，位列全球第65位；同时在2019U.S.NEWS世界大学排名，位列全球第119位。
理科优势专业：生命科学、数学、物理学、化学
1. 东京大学
东京大学是一所世界级著名研究型综合大学，作为日本最高学术殿堂和七所旧帝国大学之首，其在全球都享有极高的声誉。作为亚洲的实力强悍的学校之一，东京大学的理科和工科也在世界上处于领先地位。
根据2019年发布的QS世界大学排名位列世界第23名，日本第1名。
理科优势专业：生命科学、化学、计算机科学及信息系统（东大的理科都很强，没有特别明显的专业差距。）
