日本的新干线系统是一个庞大且高效的高速铁路网络，覆盖了日本大部分主要岛屿（本州、九州、北海道）。以下是主要的在运新干线线路、在建/规划线路以及一些重要的“迷你新干线”线路：
一、主要的新干线干线（在运）
1.东海道新干线：
连接城市：东京-名古屋-京都-新大阪
运营商：JR东海
重要性：1964年开通，连接日本东京圈和大阪圈两个商圈。
主要车型：N700系。
列车种类：希望号、光号、回声号（速度递减）。
2.山阳新干线：
连接城市：新大阪-冈山-广岛-博多（福冈）
运营商：JR西日本
重要性：东海道新干线的西向延伸，连接关西地区与中国、九州地区。与东海道新干线共同构成东京至博多的主干线。
主要车型：N700系，500系等。
列车种类：希望号、光号、回声号（速度递减）。
3.东北新干线：
连接城市：东京-大宫-仙台-盛冈-新青森
运营商：JR东日本
重要性：连接东京与日本东北地区。已延伸至北海道（通过青函隧道，但北海道段属于北海道新干线）。
主要车型：E5系、E6系。
列车种类：隼号、疾风号、山彦号、那须野号等（速度递减）。
4.上越新干线：
连接城市：大宫（东京）-高崎-新潟
运营商：JR东日本
重要性：连接东京与日本海沿岸的新潟县。
主要车型：E2系，E4系等。
列车种类：朱鹮号、谷川号等。
5.北陆新干线：
连接城市：高崎（东京/上越新干线）-长野-金泽-敦贺(2024年3月延伸段开通)
运营商：
*高崎-金泽段：JR东日本&JR西日本共同运营
*金泽-敦贺段：JR西日本运营(2024年开通)
重要性：连接东京与日本中部的北陆地区（富山、石川、福井），是前往立山黑部、金泽等旅游地的重要通道。、
主要车型：E7系，W7系。
列车种类：光辉号、白鹰号、浅间号等。
6.九州新干线：
鹿儿岛线：博多-熊本-鹿儿岛中央
运营商：JR九州
重要性：连接九州北部与南部。
主要车型：N700系，800系。
列车种类：燕号、樱号、瑞穗号（部分希望号直通运行至山阳新干线）。
长崎线(西九州段)：武雄温泉-长崎
运营商：JR九州
开通时间：2022年9月
特点：目前是一条相对独立的线路，从博多前往需在武雄温泉换乘特急列车“接力海鸥号”。主要车型：N700S系。
7.北海道新干线：
连接城市：新青森-(通过青函隧道)-新函馆北斗
运营商：JR北海道
开通时间：2016年3月(新青森-新函馆北斗)
重要性：连接本州与北海道。目前终点是新函馆北斗站，前往札幌需换乘特急列车。延伸至札幌段正在建设中（预计2031年春开通）。
主要车型：H5系（与东北新干线E5系基本同款）。
列车种类：隼号（与东北新干线直通运行）。
二、迷你新干线
这些线路是利用既有铁路线改造（主要是轨距标准化和电气化），使其可以运行新干线列车（通常车身较窄），并与主干线新干线直通运行。
1.山形新干线：
连接方式：在福岛站从东北新干线分出。
终点：新庄
运营商：JR东日本
车型：E3系
列车种类：翼号（与东北新干线直通运行）。
2.秋田新干线：
连接方式：在盛冈站从东北新干线分出。
终点：秋田
运营商：JR东日本
车型：E6系（与东北新干线部分列车直通运行，形成“超级小町号”）。
列车种类：小町号（与东北新干线直通运行）。
三、在建/规划中的新干线
1.北海道新干线(延伸段)：
路段：新函馆北斗-札幌
状态：建设中
预计开通：2031财年春季(目标)
2.北陆新干线(延伸段)：
路段：敦贺-大阪(新大阪)
状态：规划建设中，部分路段已开工。
预计开通：尚未完全确定，是长期项目。
3.九州新干线(长崎线武雄温泉-博多段)：
路段：博多-武雄温泉(与现有西九州段连接)
状态：规划阶段，存在争议（线路走向等）。
目标：实现博多与长崎之间的全线新干线直通运行。
4.磁悬浮中央新干线：
连接城市：东京(品川)-名古屋-大阪
技术：超导磁悬浮(L0系)
运营商：计划由JR东海运营。
状态：
东京-名古屋段：建设中，目标2027年开通。
名古屋-大阪段：规划阶段。
特点：运行时速可达500公里，将大幅缩短东京至名古屋/大阪的时间（东京-名古屋约40分钟）。虽然技术不同，但常被视为未来新干线网络的组成部分。
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