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中日制度差异
从最基础的制度上，中国和日本的研究生就有着很大的不同，这也决定了学生报考的方式，以及需要进行的申请准备，都是截然相反的。
国内实行的是学校报考制，这也是从小到大我们面临的申请制度，准备的方向就是学习与考试，即在学校内进行为应试而准备的各个方面的学习，等到完成学业之后，再参加统一的考试，由学校来选择学生。
即便是到了研究生阶段，我国高校的培养方案，依旧是以学习为日常，以考试为目的，虽然可以学到知识，但是转化率却比较低，对未来的帮助较小。
到了日本的研究生学习，则是以研究为主，对于学生的学习能力和研究能力有着较高的需求，最后结业所需要交的，也是自己的研究成果。
教学理念差异
中日的研究生教学理论，也有着根本上的不同，这样对于学生未来的出路也是拥有极大的影响的，事实上国内在这方面做的远远不如日本。
学生学习差异
在学习方面，差异也是存在的，毕竟不管是在制度上，还是在理论上，两国都是截然不同的，因此学生对待学习的态度也不同。
国内的学生处于被动的学习状态，即便是不适合，也会坚持读下去；而在日本，如果自己的课题不适合当前的导师，那么可以申请换导师，只要获得允许就可以。
但是在日本，实行的却是导师决定制，决定学生去向的，不再是学校而是导师。虽然入学需要参加考试，但是申请到了导师，才能够正式进入学习。在这一点上，和美国比较相近。
那么日本留学优势有哪些呢？
学术水平高
日本素以教育立国闻名于世，其高等教育体系为日本培养了众多优秀人才，对日本经济和社会发展的贡献功不可没。
在日本的高等教育体系中，主要分成学校教育、教学实践和学生就业三大环节。注重开发学生能力，培养学生素质，使教育与实践相结合、与社会经济相结合。
留学费用低
（1）学费低
日本大学有针对留学生的学费减免制度。国立大学约有90%的留学生学费全免，公立大学的这一比例约占50%，私立大学也有部分优秀生可以申请到学费全免。
（2）奖学金丰厚
日本的奖学金种类多、渠道多，仅政府、财团、民间提供的奖学金就多达245项(不包括大学本身)，日本政府还为留学生提供助学贷款等等。
（3）兼职收入
另一方面，留学生可以在日本打工。打工工资约为800～1200日元(60～78人民币)/小时。打工合法化和众多的工作机会为留学生勤工俭学提供了十分有利的条件。
文化环境亲和
日本的地理位置、气候条件、生活方式、风土人情、文化差异等与中国沿海地区相差不大，留学生不需要承受文化差异带来的太大压力。
就业环境好
可留日工作，收入高；也可回国，含金量相对较高。然而日本作为离中国最近的发达国家，开拓中国业务的日企，逐年增加，中国也是日本第二大贸易伙伴。
这就意味着留学生有大量的工作机会。对于具有日本学历和生活背景的留学生来说，留日经历将成为资本，将来无论是留在日本工作，还是回国求职，都有更广阔发展前景。
福利制度健全
日本的国民健康保险对留学生也非常有利。保险内诊治医疗费个人仅负担30%。还有日本大学宿舍费用低、舒适、安全性强。部分国立大学只需每月5000日元的房租，而私立大学根据学校情况、个人情况有所不同。
成功率高
在日本“30万留学生计划”的支持下，留学日本所需的担保手续、日语水平、文化程度等诸多要求都有所降低。就学、留学的区分也不像以前那样明显。越来越多的日本大学将一改往日的“传统”，更趋向于从中国直接招收留学生进入大学就读。
