一、整体情况
由于不同层级的学校的资金投入上差异很大，“双ONE流”的高校国家投入较大，学校的科研经费多；而普通公办本科院校国家也有一定投入，但少很多，并且科研经费基本很少；三本和专科学校，很多都是民办院校，国家基本没有投入，因此，主要收入来自学生的学费，科研经费基本没有。经费是一个学校的基础，有钱可以投入基建，更好的校园环境；招人，更高水平的老师；提升排名，招高考成绩更高的学生。比如深圳大学，由于当地经济较好，深圳市投入较大，有钱招聘优秀的老师，基础建设更好，这几年综合排名提升很快。
二、录取梦校就业差异
1. 录取梦校差异
双ONE流的录取梦校率比例比较高，当中包括读研率、统考研究生、海外录取梦校三个部分。
差异最大的部分是读研率，从清华大学的56%，逐步降低到内蒙古大学的10%左右。而双非院校中绝大多数没有读研资格，部分一本学校的读研率一般也在个位数，竞争非常激烈。
由于读研名额非常多，双ONE流高校的统考研究生比例一般在10%左右；这个比例跟普通高校的考研比率比较接近。排名靠后的高校，录取梦校率基本在个位数左右。
海外录取梦校主要以排名靠前的985为主。
2. 就业差异
部分就业岗位虽然没有明说，但是基本都是面向双ONE流学校，甚至有部分仅仅面向985院校。
比如，公务员招考中的选调生和定向选调生仅仅面向部分双ONE流高校。世界500强的企业招聘基本也以双ONE流为主。作为非常看重学历的金融业，部分头部企业更是要求985以上，甚至网络上还流传“清北复交之下无金融”的说法，虽然不见得正确，但是也说明了金融行业对学校要求之高。
从整体薪资待遇上看，学校越好，薪资待遇越高。但是，如《学历重要还是能力重要？高考考的好，不如大学学的好，大学毕业生薪资深入分析》一文所分析，学校间差异，远远小于校内学生间的差异。
三、学习目标上的差异
双ONE流学校学生的学习目标更清晰。清晰的目标让人的努力更为准确。
比如，清华大学的本科生中，14%的人选择出国，约58%的读研，约8%的考研，累计深造率约80%；约17%的人直接就业，基本选择的也是国内较好的政府、企业岗位。基本经过两三个学期的学习，就可以确定专业内部的排名，不管是深造还是就业，基本可以明确自己未来的努力方向。出国的，基本可以确定学校的范围；读研的，基本可以确定学校的去向；就业的，基本可以圈定几个企业。
相反，双非的学生，绝大多数去向是国内的中小企业，而这些企业千差万别。对于学生来说，非常不了解这些企业的要求，更不知道该如何准备。
从目标的清晰程度角度来说，从清北到双非，目标的清晰度越来越低。
四、教学质量上的差异
双ONE流高校的教师确实学术水平总体比普通高校的教师水平高，但是注意这说的是学术水平。而教育教学最关键的是因材施教，为不同水平的学生设计合理的教学方案。高校教师的教学水平远远无法跟初高中的优秀教师相比。因此，在教学水平上的差异有多大真的很难估计。985也存在“ppt reader”的教师，双非也有教学业务能力很强的教师。
个人感觉教学质量的最大差异一是考试难度，二是实际操作，如工科的课程训练。
同一门课程，从985到普通本科，考试难度是逐渐降低的。因为，考的太难，学生的及格率会低。最终，大四毕业时的不及格门数会增加，从而影响毕业率。而毕业率会影响一个学校的招生。
而实际操作课，比如计算机专业课程设计课程。难度是大大降低的。《普通高等学校本科专业类教学质量国家标准》计算机类附录 1.2 主要实践性教学环节”中的要求：4年总的实验总量不少2万行代码。而普通高校很多同学基本达不到，甚至有4年混下来，所有实验课都是混下来的。
就此两点的差异，使得学生在理论基础和实践能力上出现了巨大的差异。
五、社会认同度的差别
在就业之前，高校是学生和社会的唯一联系。社会对于双ONE流的认可度更高，虽然有些不公平，但却让人无可奈何。
有些企业，明确只招双ONE流大学本科毕业的学生，也就是说，可能你的第一学历不是双ONE流，哪怕你是硕士研究生都无济于事。的确出身名校会让自己在找工作时被高看一眼，也会有许多意想不到的好处。而普通大学的毕业生想要到知名企业工作，可能就不太占优势了。
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