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京都大学的起源是1861年（文久元年），在长崎设立的长崎养生所（之后改称为长崎精得馆），京都大学是继东京大学之后成立的日本第二所国立大学。创建于1897年，最 初名为“京都帝国大学”；二战后，正式更名为“京都大学”；2004年改组为国立大学法人京都大学。该校拥有京都大学iPS细胞研究所、京都大学生存圈研究所等多个世界名列前茅且仅有的科研机构。
迄2019年，京都大学已诞生11名诺贝尔奖（亚洲地区诺贝尔奖得主数量最 多的大学）、3名菲尔兹奖、1名高斯奖、5名拉斯克奖、1名陈省身奖、9名京都奖、3名日本国际奖、114名日本学士院奖、6名沃尔夫奖、4名芥川奖得主，日本首位的达尔文-华莱士奖章得主，以及五位日本首相，其世界500强企业CEO校友数居全球第12名，可谓巨擘辈出，毕业生在科研学术界至政界商界拥有举足轻重的地位。2021年QS世界大学排名世界第38。
京都大学的起源是1861年（文久元年），在长崎设立的长崎养生所（之后改称为长崎精得馆），京都大学是继东京大学之后成立的日本第二所国立大学。
京都大学现共有10个学部，各学部所属系科及附属设施有文学部，含文学、史学、哲学及人际学4系，共51个讲座，并设有文学博物馆、中亚研究所等；
教育学部，含教育学、社会学、心理学3系共14个讲座；
法学部，仅有法律学一个系含公法、民刑法、基础法学及政治学4科共39个讲座，附属图书馆中设国际政治法律文献中心；
经济学部，含经济学、经营学2系共11个讲座；
理学部，为京都大学最 大的学部之一，几乎包括自然科学各个领域，即有数、理、化、生、宇宙、地球科学等9个系共70个讲座，各系既相互独立又相互交叉，设施有两个天文台，8个火山、地震、气候、天体学等方面的观测所，4个海洋实验所，一个植物园等；
医学部，含有基础和临床两大分部的若干系科共有39个讲座，附属机构有校医院，脑神经研究、免疫学研究设施，人体先天异常标本中心，综合解剖中心，动物实验设施等。
工学部，是京都大学最 庞大的学部，含24个系168个讲座，研究领域涉及冶金、电气、自动化、航空、机械、原子能、土木建筑、化工、交通、信息工程等，附属机构有离子工程，自动化研究所、环境微量污染防治、重质炭资源转换等工程研究设施；
药学部，含药学、制药化学两系共13个讲座，附设药用植物园；
农学部，含10个系53个讲座，并有附属农场、林场、牧场、及供农学研究、亚热带作物、水产、细胞培养、农业会计等方面进行研究的设施等。
根据日本大学偏差值（入学难度）的排名，京都大学在绝大部分学科上的难度都是与东京大学并列第一。其中医学部，工学部，理学部是京都大学的优势学科，为日本甚至亚洲数一数二水平。其医学部诞生过多名诺贝尔奖生理医学奖得主，工学部工业化学科诞生过多名诺贝尔化学奖得主。经济学部，法学部等其他学部相对来说略显逊色，但仍然稳坐日本前三的位置。
为了探求真理就要争取自由研究的权利，同样也只有有了这种权利才能保证自由学风的实行。有的京大学生说：“在这里学习有种自由感，校方在学习和生活上从不施加过多的压力，有志者致学，无志者尽兴，各听其便，互不干扰。”因此，日本国内就有一种流行的说法：“想读书就去京大。”这种学风体现在教学上就是弹性的管理原则，全校实行选课制，这个制度是法学部在20年前创设的。据此学生可以打破学年的界限，只要取得规定的学分就可以毕业，且取得学分不一定要经过考试，撰写论文报告亦可取得学分。以理学部为例，在两年的专业课程的学习中，由学生自己选择最 适合的专业基础课程组合学习，然后再确定重点专业方向。专业基础课程组合分为数学类、物理类、化学类、生物类四大块，由学生任选一块。两年专业课程组合分下列四种类型搭配：自然科学展望、共同基础学科、专业基础、专业课。对外来的留学生、本科生实行自由转学和互换学分的制度。
自由的学习气氛和严谨的学风并不矛盾，学校始终认为：学习是自愿自觉的行动，要靠自己的责任感和不懈的努力，京大的特色就是要培养具有独立思考和判断能力的人。因而在这种学术氛围里用不着担心这种“过分”的弹性会导致放任自流。事实上，在京大要想拿到学位要比其他学校（包括东大）困难得多。
同时，京都大学位于日本历代的古都，有着悠久的日本传统历史和文化；远离首都的政治中心和繁华的大城市，为学者准备了潜心治学的理想场所；优美的校园自然环境；京都人那种“优哉游哉”的生活方式，这些独特的学术环境与京都大学成果累累、人才荟萃都是分不开的。
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