1945年,受第二次世界大战影响,学校的日吉校区、三田校区和四谷校区(现信浓町校区)损失惨重。三田校区中一半以上的设施被烧毁,图书馆被毁一半,四谷校区(现信浓町校区)失去了大约六成的校舍、医学院、研究所等设施,日吉校区的设施则被美军所占领,直至1948年才归还日本。
1949年,学校因学制改革而成为新制大学,并且与国际大学:美国罗德岛州的布朗大学合作办学。于1981年将工学部改组为理工学部,并增设两个专业成为理工学部,并于1988年将女子厚生学院改为庆应义塾看护短期大学看护学科。1990年,学校成立了湘南藤泽校区,此为政策管理学院、护理与医疗学院、环境与信息研究学院所在地。同年,纽约庆应义塾学院成立,在美国提供高中教育。1992年,学校设立了京王湘南藤泽初中高中。1994年,学校成立了研究生院媒体与治理研究科, 并将总合政策研究所、环境情报研究所与语言交流研究所改组为SFC研究所。2008年,学校的商学院与法国高等商学院ESSEC签订MBA双学位合作协议, 同年学校开办了药学部、药学研究科、系统设计管理研究科、媒体设计研究科,日吉校区的学塾综合楼——京成馆也竣工开放。2013年,学校成立了京王横滨小学。2015年,学校成立125周年。学校设立的砺町校区于2016年开始招生办学。









