宾夕法尼亚大学生物工程硕士项目提供科学和工程基础的跨学科教育，重点是生物工程领域的新发展。该项目主要目标是为学生提供定制的课程，旨在为他们在工业、研究和开发、政府或学术界创造性地独立运作做好准备。学生通常在第1年期间，与硕士生导师协商，选择论文或非论文学位课程。学生一般在12-18个月内完成学位课程。
该项目提供严格和先进的工程培训，重点是生物和医学科学。弹性课程允许学生选择自己的研究生课程，包括数学、生医科学、生物工程以及其他科学和工程学科。宾夕法尼亚大学有一个“一所大学”的理念，学生可以从大学的任何学校注册课程。我们的学生通常选修工程学院、文理学院和医学院的课程。
宾夕法尼亚大学生物工程硕士项目为学生提供了8个研究领域，包括：生物医学数据科学与计算医学、生物医疗仪器、细胞组织组成与辐射物理、系统与合成生物学、神经工程学、多尺度生物力学、治疗学药物传递与纳米医学。学生必须在其选择的研究领域完成至少4门课程，其中2门必须与生物工程有关。
宾夕法尼亚大学MSE学位，要求学生必须修读10门5000级或以上的课程。包括：1门数学课程、1门生物科学课程、2门生物工程研究生课程、3门SEAS或生物科学选修课以及1门来自任何科学或工程学科的普通选修课。
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