法学,法学系是法兰克福大学重点发展的院系,近几年邀请了许多知名教授加入。其中有德国最著名的刑法学者之一的Albrecht,德国联邦宪法法院(德国最高法院)的副主席也曾经在法兰克福大学任教和从事研究活动,宪法法院长期顾问,现在德国行政学院教学的Wieland也曾在大学长期任教。与金融相关的银行法,证券法等也是法兰克福大学的优势科目。
教育社会学,法兰克福大学的教育系以及社会学系集中了多位知名学者。如Brumlik。
1924年创立的汉学系拥有德国第一个中国研究所,由国际著名汉学家、法兰克福大学教授卫礼贤所创。这造就了德国汉学的第一次繁荣。
如今,法兰克福大学汉学系专职教授数量领先于其他大学的汉学系(同样设四席以上专职教授的汉学系有:海德堡大学汉学系、柏林自由大学汉学系)。根据合作协议和教学安排,法兰克福大学汉学系本科生将在北京大学或复旦大学完成半年学业。
法兰克福的医学,化学和物理也享有盛名,诺贝尔奖获得者众多。