在日本，所谓国立大学就是国家直接设置的大学和国立大学法人设置的大学。国立大学法人是国家全额出资的团体。但自从2004年4月1日的新学年开始，所有国立大学都要根据国立大学法成立独立的法人组织。 日本国立大学总数不到100所，基本上都是一流大学， 2012年TIMES世界排中，TOP200中有将近10所日本大学入选.日本国立大学都设有大学院(研究生院)，开设硕士、博士课程。就读日本国立大学大学院的学生持有留学签证，申请奖学金、享受医疗保险、就业、交通费折扣等方面拥有更多的机会和优惠。 在专业方面，日本国立大学的设置也比较齐全。其中，既有东京大学、京都大学、东北大学、大阪大学等知名度高的综合性大学，也有小樽商科大学、京都工艺纤维大学、爱知教育大学等侧重某些专业的大学，更有北陆先端科技术大学院大学、政策研究大学院大学、奈良先端科学技术大学院大学等综合排名不高，但是某些具体专门专业代表了教育最高水平的学校。
东京大学 1877年(明治10年)，东京开成学校与东京医学院合并，诞生了由法学部、理学部，以及文学部3个学部和医学部构成的大学：东京大学。东京大学是日本创办的第一所国立大学，也是亚洲创办最早的大学之一。 目前，东京大学有10个学部，15个研究生院研究科及教育部，11个附属研究所，17个全学中心，另外还有附属医院等很多学部，研究生院研究科，以及附属研究所的附属设施和图书馆。
东京工业大学 东京工业大学正式建立于1929年，前身是由以培养工学方面专业人才为办学目的的"东京职工学校"。 该校大学本科(日本称为学部)分为3个学部，7类共约30个学科。研究生院(日本称为大学院)则分为理工学研究科、综合理工学研究科、生命理工学研究科、情报理工学研究科、社会理工学研究科及创新经营管理研究科等6个研究科。另外还包括资源化学研究所、精密工学研究所等等 150 余个学内共同教育研究设施。
京都大学 京都大学于1869年建立，1897年开设大学教育，简称"京大"。 京都大学的业生和研究人员取得过许多荣誉，其中7人获得了诺贝尔奖，2人获得了菲尔兹奖，1人获得了高斯奖，在国际上有着高度评价。京都大学拥有充实、尖端的研究室和研究设施，也为学生们提供了成长不可缺少的实践性以及实用性的经验。 京都大学现共有10个学部，各学部所属系科及附属设施有文学部，含文学、史学、哲学及人际学4系，共51个讲座，并设有文学博物馆、中亚研究所等。
大阪大学 ・大阪大学位于日本关西地区工业城市大阪，与其他的帝国大学不同，大阪大学是有民间力量向政府申请创办的。 2007年，该校与大阪外国语大学合并，目前在吹田，丰中，箕面3个校区设有11个学部，16个研究科，5个研究所，2个附属医院，25个校内共同教育研究设施，并在旧金山，格罗宁根，曼谷以及上海4个地点设立了海外教育研究基地。 日本著名漫画家手冢治虫、索尼创始人盛田昭夫等人均毕业于大阪大学。
名古屋大学 名古屋大学的历史可追溯到1871年成立的临时医院和临时医学校，1939年创建为名古屋帝国大学。 名古屋大学现在拥有9个学部(本科)，13个研究科(研究生院)，3个研究所和19个研究中心。 名古屋大学的优势在于国际领先的卓越研究实力，21世纪的9名日本诺贝尔奖获得者中有4人与名古屋大学有关。以"21世纪卓越研究基地计划(COE)"和"全球COE项目"为代表的政府研究项目中名古屋大学的中标率在全国也是出类拔萃。
东北大学 东北大学创立于1907年，是继东京帝国大学、京都帝国大学后的第三个帝国大学。 学校最初在仙台建立名为明伦养贤堂的医学院，经过多次重建，成为仙台医学専门学校，这是东北大学医学院的雏形。1907年，学校更名为东北帝国大学，施行开放的教学政策，成为日本第一所接收女学生和外国学生的大学。 2002年诺贝尔化学奖获得者田中耕一、中国的文学大师鲁迅、数学家苏步青等均出自此校。
一桥大学 一桥大学位于日本东京都国立市，其前身为1875年创设之商法讲习所，1920年升格成东京商科大学，1949年更改为现在的校名。一桥大学是日本国内的旧制三大商科大学之一。 一桥大学为日本培养了大批人才，日本财经界多数领袖毕业于该校，在日本享有"财界领袖的摇篮"的美誉。 近年来，一桥大学在法学领域的研究教育也相当领先，由于在学术和财界极好的声誉，长期以来其毕业生有"就职的贵族"的称号，极受企业的欢迎，甚至超过东京大学和京都大学。
北海道大学 北海道大学创立于1876年，其前身为札幌农学院，是日本首座授予学士学位的大学，如今已发展成为在日本居于领先地位的国立综合性大学。 北海道大学拥有一流的研究人员和教育科研设施，现有12个本科院系，18个研究生院以及27个研究所(研究中心)，约有教职工4000人，本科生12000人，研究生6000人，进修生630人，包括1193名外国留学生，其中572名为中国留学生。
东京大学 
东京工业大学 
京都大学 
名古屋大学 
名古屋大学 
一桥大学 
东北大学 
北海道大学
