美本约翰霍普金斯夏校之旅 | 从实践中追求知识的乐趣
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海外生活

时间:2019-12-08

 我想要谈谈的我的夏校经历。我的夏校是在约翰霍普金斯大学完成的。我选修的课程是Introduction to the laboratory research。我在这个课程中学习到了许多新东西。除了新知识之外,这个课程还改变了我的学习方式和态度。它让我从消极被动的学习状态转变到开始自己主动学习,变得有钻研精神了。
在之前的中国式授课中,老师向我们展示了微量移液器(micropipette),介绍了它的使用方法和功能。并没有让我们亲自动手操作过,我也只是有这个印象,对它的作用和使用方法只是靠死记硬背,没有什么热情去对它的具体操作方法深入了解。

在JHU的第一节课,也是学习如何使用微量移液器。我们需要先确定所需要的量程,因为每个不同的量程需要使用不同的容量管。使用micropipette需要注意许多事情。这些都是我们在之前的课堂上不曾亲身体验过的东西。而在这里,我通过亲身体验来学习这些东西,让我亲身体会到这些知识是真实存在在身边的。这种学习方式让我感受到学习知识的乐趣,这种通过实践来追求知识的乐趣。

 

之后,我们需要做一个group project,叫做系统发育树(phylogenetic tree)。我们先在JHU的后花园里面采集了一些样本,为明天的的实验做准备。在上课之前,我主动去预习与phylogenetic tree相关的内容,比如如何画遗传树,nodes,roots,terminal branches,和internal branches分别代表着什么。

在采集到样本之后,回到宿舍里,我并没有把样本放在一边等实验结束后公布序列再去确认物种是什么,而是自己通过样本的形状和叶脉来判断是哪个类型的样本。我先确定我的样本是橡树一类的,然后再通过叶子的轮廓确定是美国红橡树(American Oak Tree)。之后我特意前往专业网站查询美国红橡树的适宜居住的环境,确定与美国的生态环境相符,属于深根性树种,耐瘠薄、抗火灾、萌蘖能力强,喜砂壤土、硅质粘上或排水良好的微酸性土壤,耐环境污染,对贫瘠、干旱、不同酸碱度的土壤适应能力强,耐荫能力中等,喜光照。

 

在之后的实验中,我们需要根据一个protocol来完成这个实验,然而有些在protocol中的步骤的目的或者用途我不是很明晰,比如需要往一个容器中加入一些液氮,然后将样本放进去研磨。在实验的过程中也出现了与预期实验现象不符的情况,我的样本在加入DNAzol 和 chloroform之后离心,发现残留在管壁上的样本量很少。在进行DNA样本提纯之后我们进行DNA的浓度检测时,发现我的浓度曲线与预期曲线有差异。然而我在课堂上提出的时候,教授说没办法单独解决这种比较特殊的实验情况,只能讲解大部分人出现的情况。而且在课堂上好像也没有学生了解为什么会发生这种事情。在回宿舍的路上甚至在晚上写作业的时候都在思考为什么会出现这种情况。想了想还是得靠自己,自己探究出来的知识才会记得最牢固,更加有意义。

在研磨过程中,为了将样本里的DNA更好地取出来,需要通过DNAzol溶液来破坏细胞壁,稳定DNA和去除RNA,将样本浸泡在溶液中。而且为了取出最大化的样本,就要加大接触面积,所以需要研磨。然而输液是柔性的,不好碾碎,只好将其浸泡在低温中将其固化再碾碎成小碎片状加大接触面积。在样本量中,我不仅想知道为什么我的样本会如此地少,而且想知道这几个变量是如何控制样本量的。我设计了几组实验,分别控制DNAzol和chloroform的量,离心的速度。我发现,过少的DNAzol会导致样本量偏少,过少的chloroform也会导致样本量偏少,离心速度的改变会导致管壁上残留下不同的物质,可能包含杂质在其中。

 

我为了了解为什么DNA浓度曲线会有不同时,我想起之前教授讲过样本中可能残留蛋白质导致其曲线不同,我便取少量我的样本进另外一个试管,往其中加入少量的双缩脲溶液,在55到65摄氏度中水浴加热,发现溶液并没有变成紫色,所以里面并没有蛋白质。我打算继续探究下去,我观察发现我的图像就好像缩小般的原图,然后我询问教授标准的浓度大概是多少,一对比发现刚好是等比例缩小,所以问题出现在浓度这里。之后我们将样本送去专门的公司去检测序列。然后我们将各自的DNA序列放到一个专门的网站里面去做出一个遗传树。

在这一段时间里,我靠自己探究出不少的东西,这个过程中不仅仅是探究,而是在探究与实验中学习知识。

 

在这个实验中,我主动去了解与美国红橡树相关的知识,主动预习与遗传树相关的内容及其画法,在实验结果与预期实验结果不同的时候会主动去探究为什么会发生这种状况,会自己主动深入探究。这与之前在国内学习的我完全不同,我做出了改变,我变得会自己主动去探究,去主动深入了解知识。在错误和失败中总结规律,这都是我之前不曾做到的。我很感谢这次夏校给我带来了这么大的改变,为我今后的学术生涯打好了铺垫。

 


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刘思怡美本主管

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 我想要谈谈的我的夏校经历。我的夏校是在约翰霍普金斯大学完成的。我选修的课程是Introduction to the laboratory research。我在这个课程中学习到了许多新东西。除了新知识之外,这个课程还改变了我的学习方式和态度。它让我从消极被动的学习状态转变到开始自己主动学习,变得有钻研精神了。
在之前的中国式授课中,老师向我们展示了微量移液器(micropipette),介绍了它的使用方法和功能。并没有让我们亲自动手操作过,我也只是有这个印象,对它的作用和使用方法只是靠死记硬背,没有什么热情去对它的具体操作方法深入了解。

在JHU的第一节课,也是学习如何使用微量移液器。我们需要先确定所需要的量程,因为每个不同的量程需要使用不同的容量管。使用micropipette需要注意许多事情。这些都是我们在之前的课堂上不曾亲身体验过的东西。而在这里,我通过亲身体验来学习这些东西,让我亲身体会到这些知识是真实存在在身边的。这种学习方式让我感受到学习知识的乐趣,这种通过实践来追求知识的乐趣。

 

之后,我们需要做一个group project,叫做系统发育树(phylogenetic tree)。我们先在JHU的后花园里面采集了一些样本,为明天的的实验做准备。在上课之前,我主动去预习与phylogenetic tree相关的内容,比如如何画遗传树,nodes,roots,terminal branches,和internal branches分别代表着什么。

在采集到样本之后,回到宿舍里,我并没有把样本放在一边等实验结束后公布序列再去确认物种是什么,而是自己通过样本的形状和叶脉来判断是哪个类型的样本。我先确定我的样本是橡树一类的,然后再通过叶子的轮廓确定是美国红橡树(American Oak Tree)。之后我特意前往专业网站查询美国红橡树的适宜居住的环境,确定与美国的生态环境相符,属于深根性树种,耐瘠薄、抗火灾、萌蘖能力强,喜砂壤土、硅质粘上或排水良好的微酸性土壤,耐环境污染,对贫瘠、干旱、不同酸碱度的土壤适应能力强,耐荫能力中等,喜光照。

 

在之后的实验中,我们需要根据一个protocol来完成这个实验,然而有些在protocol中的步骤的目的或者用途我不是很明晰,比如需要往一个容器中加入一些液氮,然后将样本放进去研磨。在实验的过程中也出现了与预期实验现象不符的情况,我的样本在加入DNAzol 和 chloroform之后离心,发现残留在管壁上的样本量很少。在进行DNA样本提纯之后我们进行DNA的浓度检测时,发现我的浓度曲线与预期曲线有差异。然而我在课堂上提出的时候,教授说没办法单独解决这种比较特殊的实验情况,只能讲解大部分人出现的情况。而且在课堂上好像也没有学生了解为什么会发生这种事情。在回宿舍的路上甚至在晚上写作业的时候都在思考为什么会出现这种情况。想了想还是得靠自己,自己探究出来的知识才会记得最牢固,更加有意义。

在研磨过程中,为了将样本里的DNA更好地取出来,需要通过DNAzol溶液来破坏细胞壁,稳定DNA和去除RNA,将样本浸泡在溶液中。而且为了取出最大化的样本,就要加大接触面积,所以需要研磨。然而输液是柔性的,不好碾碎,只好将其浸泡在低温中将其固化再碾碎成小碎片状加大接触面积。在样本量中,我不仅想知道为什么我的样本会如此地少,而且想知道这几个变量是如何控制样本量的。我设计了几组实验,分别控制DNAzol和chloroform的量,离心的速度。我发现,过少的DNAzol会导致样本量偏少,过少的chloroform也会导致样本量偏少,离心速度的改变会导致管壁上残留下不同的物质,可能包含杂质在其中。

 

我为了了解为什么DNA浓度曲线会有不同时,我想起之前教授讲过样本中可能残留蛋白质导致其曲线不同,我便取少量我的样本进另外一个试管,往其中加入少量的双缩脲溶液,在55到65摄氏度中水浴加热,发现溶液并没有变成紫色,所以里面并没有蛋白质。我打算继续探究下去,我观察发现我的图像就好像缩小般的原图,然后我询问教授标准的浓度大概是多少,一对比发现刚好是等比例缩小,所以问题出现在浓度这里。之后我们将样本送去专门的公司去检测序列。然后我们将各自的DNA序列放到一个专门的网站里面去做出一个遗传树。

在这一段时间里,我靠自己探究出不少的东西,这个过程中不仅仅是探究,而是在探究与实验中学习知识。

 

在这个实验中,我主动去了解与美国红橡树相关的知识,主动预习与遗传树相关的内容及其画法,在实验结果与预期实验结果不同的时候会主动去探究为什么会发生这种状况,会自己主动深入探究。这与之前在国内学习的我完全不同,我做出了改变,我变得会自己主动去探究,去主动深入了解知识。在错误和失败中总结规律,这都是我之前不曾做到的。我很感谢这次夏校给我带来了这么大的改变,为我今后的学术生涯打好了铺垫。

 


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