在说到这所大学的时候不得不提到日本近代比较有名的事件,泷川事件(日语:滝川事件、たきがわじけん),又名京大事件,是昭和8年(1933年)发生于京都帝国大学的一起压制思想的事件。
京都帝国大学法学部的泷川幸辰教授(后为京大校长),在其著作《刑法讲义》、《刑法读本》中,对于“通奸罪”只适用于妻子一方的法律提出批判。泷川的这一主张,遭到了贵族院议员菊池武夫和政友会宫泽裕等人的攻击,被指责为共产主义的学说,因此上述著作被禁止发售。不过在这之前,大审院却认为这两本着作非常有价值,还介绍给部下熟读, 斋藤实内阁的文部大臣鸠山一郎甚至对京大校长小西重直提出罢免泷川的要求。尽管校长拒绝了这个要求,但根据文官分限令,泷川仍被迫停职。
面对这个事态,京大法学部全体31位教授提出辞职以表抗议,消息传出后变成学潮,东大、东北大、九大纷纷响应。但是未得到学校当局和其他学部的支持。接着,小西校长也被迫辞职,随着强硬派的新任校长松井元兴(理学博士,后为立命馆大学校长)的上任,事件迅速得到了平息。最终导致了泷川教授被免职,佐佐木惣一(后为立命馆大学校长)、宫本英雄、森口繁治、末川博(后为立命馆大学校长,总长)等教授也被免职,其余14名教官辞职的结果。
泷川事件导致京都帝国大学的17名原任教官辞职,并转往立命馆大学担任教授及助教。而这件事件亦成为了黑泽明监制的战后第1部电影《青春无悔》(1946年)的背景。